Hiccup ve Toothless, Kızıl Ölüm'ü yenilgiye uğratarak Berk halkını kurtardıktan sonra, Berk'teki Vikingler ejderhalarla barış yaparlar. Ancak Hiccup, bu uyumun zannettiği kadar sorunsuz olmadığını ve bazı ejderhaların bu anlaşmayı bozmak istediğini fark eder. Bu durumu çözmek için, Hiccup'ın babası Stoick, oğlu ve arkadaşlarının ejderhalar hakkında her şeyi öğrenebileceği Berk Ejderha Akademisi'ni kurar. Akademide, huysuz Mildew ve kötü niyetli Alvin gibi karşı çıkanlar olsa da, Berk'in genç Vikingleri ve ejderhaları, hayati bilgiler edinmek için birlikte çalışır.
