Hikâye, mutantların "normal" insanlara dönüşebileceği bir "tedavinin" keşfiyle başlar. Bu tedavi, mutant topluluğunda büyük bir tartışma yaratır. Rogue gibi bazı mutantlar bu tedaviyi cazip bulurken, birçok mutant kimliklerinin ve doğalarının değişmemesi gerektiğini düşünerek karşı çıkar. Bu konu, mutant topluluğu arasında öfke ve ayrışmaya neden olur. Radikal mutantlardan Magneto, bu tedaviyi destekleyen Warren Worthington II'ye büyük tepki gösterir ve tedavinin yayılmasını engellemek için büyük bir mutant ekibi oluşturur. Magneto, mutant haklarını savunan X-Men ekibini durdurmayı amaçlamaktadır.
