Film, 1960'larda geçer ve süper güçlere sahip Charles Xavier ile Erik Lensherr'in hikâyesini anlatır. İkili, benzer yeteneklere sahip diğer insanlarla iletişim kurmak ve onları korumak amacıyla güçlerini birleştirir. Ancak, Erik'in geçmişindeki trajik olaylardan kaynaklanan intikam hırsı, onları ayırır. Bu ayrılık, ortaya çıkan intikamcı bir mutant tarafından daha da derinleşir. Xavier ve Erik, bir zamanlar birlikte çalışsalar da farklı yollara giderler. Film, insanlık için yeni bir umut arayışını ve bu arayışın gölgesinde kalan ayrılığı konu alır.
